软件著作权的专属登记机构是中国版权保护中心，防城港暂无独立受理该业务的机构，可通过线上全国统一平台申请，也能借助当地版权登记工作站协助相关事宜，具体方式如下：
1. 线上全国统一申请：这是最便捷的方式。登录中国版权保护中心官网的软件著作权登记系统，注册账号后按指引填写申请表，上传软件源程序、使用说明书等鉴别材料以及申请人身份证明等相关文件，后续审核、缴费等流程均可在线完成，审核通过后会邮寄证书。
2. 借助当地版权登记工作站协助：防城港港口区设有自治区版权登记工作站，虽其主要受理计算机软件外的其他作品版权登记，但可咨询该站获取软件著作权申请的流程指引与材料整理建议。
3. 委托代理机构办理：若不便自行办理，可委托有资质的知识产权代理机构代办。这类机构熟悉软件著作权申请的全套流程和材料规范，能高效完成申请事宜，防城港本地及广西区内均有合规的知识产权代理机构可选择。
