云南普洱软件著作权登记的申请流程与全国其他地区一样，都是通过中国版权保护中心进行申请，具体如下：
1.准备材料
软件著作权登记申请表：在中国版权保护中心官网下载或在线填写，确保信息准确无误。
软件的鉴别材料：包括程序和文档的鉴别材料。程序和文档的鉴别材料应当由源程序和任何一种文档前、后各连续30页组成，整个程序和文档不到60页的，应当提交整个源程序和文档。除特定情况外，程序每页不少于50行，文档每页不少于30行。
相关的证明文件：自然人、法人或者其他组织的身份证明；有著作权归属书面合同或者项目任务书的，应当提交合同或者项目任务书；经原软件著作权人许可，在原有软件上开发的软件，应当提交原著作权人的许可证明；权利继承人、受让人或者承受人，提交权利继承、受让或者承受的证明。
2.提交申请
账号注册与实名认证：访问中国版权保护中心自助服务平台，注册账号并完成实名认证。
填写申请表：在“软件著作权登记”模块，选择“在线申请”，逐项填写表单信息并上传申请表电子稿。
上传材料：将准备好的软件鉴别材料、证明文件等上传至系统。
提交申请：确认信息无误后，提交申请。申请文件可以直接递交或者挂号邮寄。申请人提交有关申请文件时，应当注明申请人、软件的名称，有受理号或登记号的，应当注明受理号或登记号。
3.审核与下证
受理阶段：申请材料符合受理要求的，中国版权保护中心将在5-7个工作日内发出《受理通知书》。
审查阶段：中国版权保护中心自受理日起60日内审查完成所受理的申请。如果申请材料存在问题，需要申请人补正，申请人应当在30日内补正，逾期未补正的，视为撤回申请。
证书下发：审查通过后，申请人可登录中国版权保护中心官网查阅软件著作权登记公告，并在官网用户中心下载软件版权登记电子证书。
